水冷型干燥機若冷卻水質較差時，應在入口處加裝冷卻水過濾器過濾雜質。冷卻水水溫在32oC以下較為佳，水壓應保持在0.15-0.50MPa之間。
干燥機運轉時，本身的振動，僅在地基松軟處才需要做水泥基礎，地基需選擇平坦的地方。應避免由管路傳來的空壓機的振動影響，如太嚴重時需要接上高壓軟管，以消除振動。
自動排水口出口應接直達排水管直達排水溝，以免污染生產現場，排水溝高度應低于自動排水器出口。
冷干機接在氣源系統中，好在空氣入口和出口之間并聯旁路管道，中間設截止閥以供調試、維修和啟動時使用。
真空冷凍干燥機的詳細使用方法如下：
一：標準型
1)將樣品放入料盤中，然后將料盤放入凍干架中，放置并固定樣品溫度傳感器，將凍干架放入冷阱中，蓋上保溫蓋進行預凍，預凍至樣品完全凍結并保存一段時間。
2)從冷阱中取出預凍材料托盤和凍干架，將支撐托盤放在冷阱口上方，將凍干架放在支撐托盤上，用玻璃罩蓋住。
3)擰緊充氣閥，點擊屏幕上的“真空表”按鈕，屏幕顯示真空度為110kpa，然后點擊“真空泵”按鈕啟動真空泵。真空度迅速下降，小于等于10Pa為正常。
也有一部分水霧在經過過濾器時被集中和除去。冷凍干燥機過濾器的主要作用是過濾壓縮空氣中的固體顆粒。從空壓機出來的熱而潮濕并含有水份的壓縮空氣首先經過空氣對空氣熱交換器預冷卻;然后經過預冷卻的空氣，在空氣對冷媒熱交換器被冷干機的冷凍劑循環回路進一步冷卻，冷凍干燥就是將含水物質，先凍結成固態，而后使其中的水分從固態升華成氣態，以除去水分而保存物質的方法。
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